竞业协议调查不一定能调查出竞业员工违规。这是因为竞业协议的调查受到多种因素的影响，包括但不限于以下几点：

1. 信息不对称：员工可能采取隐蔽的方式违反竞业协议，特别是在当前员工可以在全国范围内就业，工作方式灵活的背景下，用人单位可能难以获取员工的全部信息，从而增加了调查的难度。

2. 证据要求严格：要追究员工违反竞业限制协议的责任，需要取得可以被法院采信的证据。然而，法律对证据的要求比较严格，有时可能难以获得相关证据，这可能导致用人单位在评估事态后选择放弃追究。

3. 竞业限制期限短：竞业限制期限通常为两年，有时甚至更短。在限制期限内，用人单位可能只能获取到一些蛛丝马迹，而等到发现确凿证据时，竞业限制期可能已经结束，甚至超过了仲裁时效，这也会使得调查变得困难。

因此，尽管竞业协议的调查是为了保护用人单位的利益，但在实际操作中，由于各种因素的影响，调查可能并不能保证一定能查出员工的违规行为。